اهداف “مرکز پژوهشی معمارخانۀ باغ شهر” در دو حوزۀ مهم پژوهش و کاربست این دستاوردها در حوزۀ اجرا
برنامۀ کلی این مرکز، انجام پژوهش مطابق با استانداردهای علمی و از آن مهم تر چگونگی کاربست این دستاوردهای حاصل از پژوهش در حوزۀ اجرا است. در ادامه به ده هدف مهم این مرکز اشاره خواهد شد. این اهداف عبارتند از:
1- تدوین برنامه ای کامل و جامع در راستای معرفی ارزش های معماری و شهرسازی و همچنین ارزش ها و سنت های حفاظت و مرمت آثار و ابنیۀ تاریخی در ایران (گذشته و حال) به سایر کشورها، ثبت نمودن بناهای واجد ارزش تاریخی و یا مدرن و همچنین محورهای فرهنگی تاریخی و فنون سنتی واجد ارزش در فهرست میراث جهانی،
2- شناخت، نقد و ارزیابی تجارب معماری، شهرسازی و حفاظت و مرمت در ایران و استخراج نکات و ارزش های مطلوب نهفته در آن
3- تلاش در جهت استفادۀ بهینه از اصول و قواعد قابل تعمیم معماری و شهرسازی و همچنین سنت های حفاظت و مرمت آثار و ابنیۀ تاریخی گذشته در معماری و شهرسازی و حفاظت و مرمت امروزی، در جهت ارتقاء كيفيت مهندسي طراحي و معماري و همچنین محیط های شهری و مقولۀ حفاظت و مرمت، متناسب با مقتضيات علمي، بومي و فرهنگي هر منطقه، و تبیین و توسعۀ اصول و مبانی بنیادی و کاربردی معماری و شهرسازی پایدار
4- تلاش در راستای توسعه و تبیین اصول و مبانی بنیادی و کاربردی معماری، شهرسازی و حفاظت و مرمت ایرانی-اسلامی.
5-تلاش در راستای انتشار کتب تخصصی و سایت های علمی مرتبط با مقولۀ معماری و شهرسازی و حفاظت و مرمت
6- تدوین مبانی آسیب‌شناسی و نیازسنجی پژوهش در معماری و شهرسازی و مقولۀ حفاظت و مرمت ایران، به انضمام بررسی و شناخت نظریه‌ها و مبانی نوین پژوهش در معماری، شهرسازی و حفاظت و مرمت
7- شناسایی سبک ها و ارزش های معماری سنتی و مدرن و همچنین ارزش ها و سنت های حفاظت و مرمت در بناهای تاریخی مختلف نظیر مدارس، مساجد و … و در بناهای معاصر مختلف نظیر بانک ها، ادارات، فضاهای فرهنگی و همچنین ارزش های شهرسازی سنتی ایران
8- گزینش برترین نمونه های واجد ارزش معماری سنتی و مدرن و همچنین برترین شهرهای دارای الگوی شهرسازی مناسب در اقلیم های مختلف و یا برترین نمونه های واجد ارزش حفاظت و مرمت در بناهای تاریخی، مستندنگاری علمی و تهیۀ بانک اطلاعاتی مدون
9- شناخت، نقد و ارزیابی تجارب با ارزش معماری، شهرسازی و حفاظت و مرمت در جهان، و شناسایی مهمترین چالش های روز در مقولۀ معماری و عمران و توسعۀ شهری و همچنین حفاظت و مرمت
10-برگزاری جلسات هم اندیشی تخصصی مرتبط با مقوله های فوق الذکر، همکاری با سایر بخش‌ها در انجام پروژه‌های مشترک و مرتبط، برگزاری دوره‌های آموزشی و همچنین جشنواره‌ها و همایش‌های مرتبط.